2001年初，在学校体制改革的推动下，科研处正式独立设处。洛秦教授、肖梅教授、钱仁平教授、伍维曦教授担任历任处长，现任负责人为王丹丹教授。
科研处成立以来，将自己的角色定位在“组织项目申报、争取科研额度、承接重大项目、督促项目进程”上。 本着“以服务体现管理、以管理促进服务、以服务促进科研、以项目促进学科发展”的原则，积极配合全院建设的统一规划，树立科研服务意识。
科研处主要职能如下：
1. 科研规划：根据学校一流学科建设的要求与战略部署，拟定科研工作的中长期规划和年度计划；对应各类项目申报、评选工作，提前进行规划、部署。
2. 科研管理制度：研究制定全校科研工作的政策措施、管理细则、奖励办法等，推进学校科研治理工作。
3. 科研项目管理：各类科研项目（包括智库、研究基地）申报、立项、中期检查、结项等全流程管理与专业服务。
4. 科研培育：以“蔡元培讲坛”为平台，开展专家讲座、专题会议与信息报送等形式，传递、交流创新观念与创新领域。开展相关项目培育与资助工作。
5. 科研成果管理：按照国家有关规定，做好各类个人科研成果的鉴定、评审、验收、公告、评奖、推广应用及保密等工作。落实好“科研育人”思想，促进科研成果的转化工作，不断探索科研与欧宝娱乐棋牌官网的关联机制。
6. 科研档案管理：全校科研档案的整理、归档工作。
7. 科研统计：完成教育部全国普通高校人文社科统计，及对接教育部对科研成果的要求完成院内年度科研成果统计；并向校内外各部门提供统计数据咨询。
8. 科研情报信息服务：科研动态、科研申报等信息的观察、收集、整理、发布等工作，拓展各类纵、横向项目的申报空间。
9. 科研经费管理：会同财务处进行科研经费的立账管理；督导科研经费的合理使用，并配合相关部门对科研经费的审计。
10. 完成校领导交付的其它工作任务。
